微信付款扣零钱通的过程是这样的：首先需要有零钱通余额，若付款金额小于或等于零钱通余额，则直接扣除零钱通余额完成交易；若付款金额大于零钱通余额，则从绑定的银行卡中扣除差额，再从零钱通中扣除付款金额，最终完成交易。需要注意的是，如果绑定的银行卡余额不足以支付差额，则支付交易将失败。同时，为了保障付款安全，微信付款也进行了一系列的防欺诈措施，如登录验证、支付密码等。
微信付款时扣零钱通的步骤如下：首先确保零钱通账户里有足够的零钱余额；在微信上选择需要支付的对象，进入付款页面，在“付款”页面中选择“零钱”方式支付。
如果您的微信钱包中余额不足，会弹出提示框，提示您是否使用零钱通余额进行支付，选择“是”后输入支付密码即可完成付款，金额将从零钱通中扣除。如果您有需要的话，还可以在“钱包”中进行零钱通余额的充值。