1.待遇有区别：副科待遇和真正的副科级，在具体的岗位薪资及福利待遇上有区别，副科级所拥有的福利待遇更高。
2.实际职务有区别：副科待遇的职务并非实权职务，副科级则是实权职务，后者往往是负责领导、管理之类的工作。
副科的全称叫副主任科员。
副科（minor
subject），亦称"副课"。除主科以外的其他必修学科的俗称。如中国中小学的历史、地理、自然、物理、化学、生物等学科；有时专指体育、音乐、美术、劳动技术等学科。
区别之一：指向不同。副科是特指副科长或者副科级，副职是泛指各级别的副手职位。
区别之二：责权不同。副科在领导职务层级排序上是最低的，所以在责权上是最小的；副职在各级领导职务中均有设置，所以在责权上是不等的。