是的，小型车超员20%要扣分。

因为根据2021年4月1日起实施的《道路交通安全法》修订案，小型车超员20%以上将被罚款200元并扣3分，同时车辆所有人也将被罚款200元。

因此，小型车超员20%以上的情况一定会被扣分。

延伸内容：交通安全是社会稳定的重要保证和人民幸福的重要基础，遵守交通规则是每个人的责任。

作为驾驶员，应该提高安全意识，遵守交通规则，不超员、不超速、不酒驾，确保自己和他人的安全。