古代军户和农户是两种具有明显区别的户籍类型，它们的主要差异体现在以下几个方面：

首先，从职责与义务的角度来看，军户是专门负责军事任务的家庭，其主要职责是承担服兵役的义务，为国家提供军事力量。他们被官府指定为出军的人户，世代为兵，社会地位相对较低。相比之下，农户则是以农业生产为主要职责的家庭，他们主要承担耕种土地、提供粮食等农产品的任务，是农村经济的基础。

其次，从经济来源与待遇方面来看，军户通常被分配一定的土地，这些土地是他们经济的主要来源。然而，由于他们需要承担军事义务，因此可能无法全身心地投入农业生产。相比之下，农户则专注于农业生产，通过耕种土地获得收入。在待遇方面，军户可能会得到一些由政府提供的口粮和衣装等物资，但也可能需要承担更多的杂役和差役。

最后，从社会地位与流动性来看，由于军户需要世代为兵，他们的社会地位相对较低，且流动性较小。而农户则可以根据土地和农业生产的情况进行一定的迁移和流动。

综上所述，古代军户和农户在职责与义务、经济来源与待遇以及社会地位与流动性等方面都存在明显的区别。这些区别反映了古代社会中不同户籍类型在家庭职责、经济生活和社会地位等方面的差异。