回答是：商转公担保费用1400不会退。因为根据住房公积金管理中心规定，以阶段性担保方式办理商转公业务时，借款人须申请经中心招标选定的有资质的担保公司提供阶段性担保，签订担保合同并支付担保费，担保公司承担连带责任保证。所以，商转公担保费用1400不会退。
商贷转公积金要自己先结清是因为不结清商贷，公积金贷款无法办理抵押就无法放款，这是人民银行贷款通则规定的。一般情况下，如果借款人想要采用公积金贷款资金直接归还原商业个贷余额的，商业个贷承办银行与公积金贷款承办银行为同一家住房公积金贷款业务的受委托银行。