荣耀Magic6至臻版采用了三摄像头设计，主镜头为5000万像素的索尼IMX766传感器，配备了f/1.9光圈和OIS防抖技术，可捕捉更清晰、更稳定的画面；超广角摄像头采用了f/2.2光圈，具备120度的广角视野，可以拍摄更广阔的场景；长焦镜头的光学变焦能力为3倍，最高支持5倍数码变焦。这三个镜头的搭配实现了更完整、更切合用户需求的拍摄体验。
虽然荣耀magic6至臻版没有自带镜头膜，但可以在购买后自行贴镜头膜，以防止摄像头被划伤或沾染指纹等。镜头膜的选择应以不影响拍照效果为前提，因此建议在购买前仔细比较不同品牌、型号的镜头膜，选择适合自己手机型号和拍照需求的镜头膜。
在贴镜头膜时，也应注意操作方法和细节，确保贴得平整、无气泡，以免影响拍照效果。
荣耀Magic6至臻版采用了Sapphire Glass（蓝宝石玻璃）做为主镜头玻璃材质，这是一种使用高纯度的蓝宝石单晶生长技术制成的人造宝石材料。相对于普通的玻璃材质，蓝宝石玻璃在硬度、抗刮擦性、抗摩擦力、耐高温等方面都具备突出的优势。此外，它还有较好的光学透过率和折射率，能够保证相机拍摄的画质清晰且细节丰富。总的来说，荣耀Magic6至臻版采用蓝宝石玻璃制作镜头，不仅具有极高的材质质量，还能够保障拍摄质量的稳定性和持久性。