过程如下所示：
其整个过程可分为质配、核配和减数分裂三个阶段。第一阶段是质配，即经过两个性细胞的融合，两者的细胞质和细胞核(N)合并在同一细胞中，形成双核期(N+N)。第二阶段是核配，就是在融合的细胞内两个单倍体的细胞核结合成一个双倍体的核(2N)。第三阶段是减数分裂，双倍体细胞核经过两次连续的分裂，形成四个单倍体的核(N)，从而回到原来的单倍体阶段。经过有性生殖，真菌可产生四种类型的有性孢子。
特征：(1)植物体为单细胞，或群体，或丝状体，或叶状体，没有根茎叶分化；
(2)有纤维素的细胞壁：外层为果胶质，黏滑；内层为纤维素；
(3)细胞内含有叶绿素或其它色素，能进行光合作用；
(4)多数种类在生活史的某些单细胞时期具有鞭毛一一高度依赖水环境。
孢子是植物所产生的一种有繁殖或休眠作用的细胞，能直接发育成新个体，孢子一般微小，单细胞。由于它的性状不同，发生过程和结构的差异而有种种名称。植物通过无性生殖产生的孢子叫“无性孢子”，如分生孢子、孢囊孢子、游动孢子等；通过有性生殖产生的孢子叫“有性孢子”，如接合孢子、卵孢子、子囊孢子、担孢子等；直接由营养细胞通过细胞壁加厚和积贮养料而能抵抗不良环境条件的孢子叫“厚垣孢子”、“休眠孢子”等。孢子有性别差异时，两性孢子有同形和异形之分。前者大小相同；后者在大小上有区别，分别称大孢子、小孢子，并分别发育成雌、雄配子体，这在高等植物较为多见。
对于人体外的真菌孢子，经过煮沸可很快杀死真菌孢子，60摄氏度经过一小时也可以杀死孢子，可采用碘酊、石炭酸、甲醛液等真菌孢子较敏感的消毒剂杀死。
对于人体上的真菌孢子可采用两性霉素B、酮康唑、克霉唑等抗真菌药物杀死。