公证过的协议在法庭上具有一定的证明力，但仍需根据实际情况综合判断。

公证员作为公证机关的代表，在协议签订时进行证明，为协议增加了证明力，可以有效地证明协议的真实性和合法性。

但若协议内容违法、不合理或未经双方自由意思表示，则其效力将受到法律的限制或排除。